世界被黑暗笼罩着。
风静止了，
海啸强烈，
大地在腐败。
人民在等待，
他们唯一的希望，
一则预言……
“世界被染成黑暗时，
4位光之战士将会出现……”
经过漫长的旅途！
4个年轻人来了，
每人拥有一块水晶。
这4个年轻人真是光之战士吗？
操纵形成世界的4种力量——
土、火、水、风的敌人能打败吗？
首先要让4大水晶恢复光辉，
阻止世界的崩溃！
即将起程了，4位光之战士！
序章
当黑暗笼罩整个世界的时候，四位光之战士出现在阔内利亚城（Coneria コーネリア）。谒见国王，得知该国公主瑟伊拉（Sara セーラ）被该国骑士噶兰多（Garland ガーランド）绑架了。整个王宫的人都焦急万分，他们都请求战士们出手帮助。经了解，噶兰多将公主转移到了城北方的卡欧斯神殿（Temple of Fiends カオスのしんでん）。
在城边的街道小镇补充一下物品后就可以上路了，来到北方的卡欧斯神殿，先到左上和左下角房间拿装备，这样就能轻松面对噶兰多了。噶兰多在神殿中央房间，位于神殿入口正北，公主就在他身后。只要体力一开始充沛，击败他不成问题……
与公主交谈，回到阔内利亚城大殿，国王了解战士们的使命后，派人到北方修复断桥。与公主瑟伊拉对话获得一个诗琴（Lute リュート）。这有什么用？以后就会知道了。在出发前先在城中转转，发现宝物库门被施加了魔法封印，门口的老者说只有神秘钥匙才能打开库门，看来只有以后再来了。
出了城，走上北方刚修好的桥……（序幕）
一、神秘钥匙
到北方找到一个洞窟，这是玛托亚洞窟（Matoya Cave マトーヤのどうくつ）。进洞看到魔女玛托亚（Matoya マトーヤ）。她由于水晶眼（Crystal すいしょうのめ）被盗而失明，啥子也看不到，一直在闷闷不乐。看来应该帮她找回水晶眼。
玩家在游戏中按住FC手柄B键不放再按选择键就会出现世界地图画面。
在遥远的东方有一个港口城镇普拉波卡（Pravoka みなとまちプラボカ），进镇后听说这里有海贼作乱。到左上找到海贼头目Bikke（ビッケ），击败他手下9个海贼后将其降服，缴获海船。
小秘密：乘船期间，如果玩家按住FC手柄A键不放，连续按B键55次，就会出现一个排数字小游戏，每赢一次获得100G。
乘船来到南方的精灵城（Elf Castle エルフのしろ），在大殿中看到已经沉睡了五年的精灵王子。而他的臣民们都纷纷请求光之战士唤醒王子。经了解，元凶是一个叫阿斯托斯（Astos アストス）的暗黑精灵，他对王子下了诅咒，但他一直行踪不明。又听说西城(Northwest Castle にしのしろ)比较奇怪。
步行来到西城，那里空荡荡的只有一个坐在王座上的国王。他请光之战士帮他找回沼泽洞窟（Marsh Cave ぬまのどうくつ）里的王冠，用王冠将阿斯托斯破坏的西城恢复原状。
回到西城，将王冠交给国王，但风云突变，那国王狂笑着现出原形——原来是阿斯托斯！一番激战后除去了这个祸害，意外得到水晶眼，没想到偷水晶眼的贼也是他。
再到玛托亚洞窟，将水晶眼交还魔女玛托亚使其复明。她非常高兴，得知光之战士想唤醒精灵王子，就非常大方地送给战士们唤醒药（HERB めざめのくすり）。回到精灵城，将其交给王子身边的侍从就可以唤醒王子。王子为表谢意，将神秘钥匙（KEYしんぴのかぎ）交给战士们。
有了神秘钥匙就能打开施加过魔法封印的门了，记得阔内利亚城里两扇被封印的门吗？在那里能找到硝基火药！
来到西方的矮人洞窟（Dwarf Cave ドワーフのどうくつ），在洞中有个叫内力克（ネリク）的矮人，他正在挖运河，但没有火药无法开通。战士们刚找到的火药正好派上用场。内力克得到火药后很快工程竣工。
乘船向下航行，很快找到西方刚开通的运河，穿过运河来到外海……
二、飞空艇
过了运河，往上来到荒废的梅露蒙多镇（Melmond メルモンドのまち）。镇中一片残败的景象，据了解，附近有吸血鬼（Vampire バンパイア）在作孽。镇中还能打听到，巨人岭（Titan's Tunnel きょじんのとうげ）的巨人喜欢宝石。
在南方三角形半岛上发现土之洞窟(Earth Cave アースのどうくつ），在地下三层找到吸血鬼。将其击败后，从旁边宝箱缴获一颗星光红宝石（Ruby スタールビー）。但这样就完结了吗？其屋后神秘的石板下会是什么呢？
到达巨人岭，果然有一个巨人挡在路口，将刚得到的星光红宝石交给他……他竟然将宝石吃了！还好他吃完后就高兴得离开了，战士们得以通过。
到了贤者萨达洞窟（Sarda's Cave けんじゃのどうくつ），贤者萨达送给战士们一根土杖，并指示在土之洞窟B3F那块神秘石板前使用……
果然，那石板在土杖的法力下碎裂了，露出下面的通道。经过漫长复杂的道路，终于找到土之水晶。使大地腐败的真正敌人——土之卡欧斯巫妖（Lich リッチ）突然出现，向光之战士发起攻击……击败巫妖后上前登上台座，土之水晶恢复了光辉。
回到梅露蒙多镇打听到有关飞空艇的消息，似乎需要某种石头使船浮起来。
乘船往西，来到世界地图东方，找到一座被新月形湖泊包围的美丽城镇——新月湖镇（Crescent クレセントレイクのまち）。在城镇右上方有12位预言家，和他们逐个对话，能了解到许多关于卡欧斯集团的情报。光之战士恢复了土之水晶的光辉后，右方5点钟位置的一位预言家会赠送一艘独木舟（Canoe カヌー），能在河流湖泊中航行。在镇中了解到，镇北冰之洞窟中有浮游石（FLOAT ふゆうせき），它能让飞空艇从沙漠中浮上来。
使用独木舟顺河流来到冰之洞窟（Ice Caveこおりのどうくつ）。在地下2层有一个被陷阱包围的宝箱，难道这里面装的是浮游石？先从一个陷阱掉下去，然后用直通的阶梯爬到地下1层，到里面房间的陷阱，再掉下去就能接近宝箱了。宝箱中装的果然是浮游石！
来到大陆南方的留康沙漠（Ryukahn Desert リュカーンきばく），在沙漠中使用浮游石，就会看到飞空艇从沙漠中浮上来。走上前按确定键就能乘坐了。要注意的是飞空艇一般只能在浅绿色草地着陆。
三、海底神殿
有了飞空艇，可以方便地往来于各地。
来到河流上游的骨碌骨火山（Volcano グルグかざん），火山内部熔岩多，在熔岩上走路会导致HP不断损伤，要准备好大量回复物品。在地下5层左下角房间找到火之水晶。当然，不可避免要和火之卡欧斯——玛丽里斯（Kary マリリス）交手……踏上石台，恢复了火之水晶的光辉！
在北方诸岛上有许多地洞，洞中住着龙族。据这些龙说，龙王巴哈姆特（Bahamut バハムート）对有勇气者授予称号。见到龙王后，居然被要求出示勇气之证，那到底是什么呢？
据情报，勇气之证在西方的试练之城（Castle of Ordealしれんのしろ），由于城周围没有飞空艇降落点，所以只好将飞空艇降落到比较远的位置，然后步行走过来。在城中找不到楼梯，没想到一楼的宝座居然是瞬移点，在二楼通过柱子也能进行空间瞬移……最后在三楼一个宝箱中找到一根老鼠尾巴（TAIL ネズミのしっぽ），难道这就是勇气之证？
回到龙之洞窟，将老鼠尾巴交给巴哈姆特。果然，这就是勇气之证，龙王施展神威，战士们的能力全部提高了，而且获得了新的职业。
乘飞空艇来到翁拉克镇（Onrac オンラクのまち）。该镇有一个用木桶做的潜水舰，由于人不能在舰中呼吸，所以暂时不能使用。现在面临的问题是寻找能提供氧气的空气之水！
到地图右上的盖亚镇（Gaia ガイアのまち），在右上角发现一处泉水，听说这里原本有个泉之妖精能吸取泉底的空气之水，但她已经被抓住卖给了商队，现在商队正在翁拉克镇西方的沙漠中。
赶到沙漠，在一片绿洲左边的沙漠中遇到商队，他们只有一种物品出售——妖精瓶（BOTTLE ようせいのビン）。花50000大洋才能“赎回”妖精。打开瓶子，那妖精头也不回地飞跑了。跟着她回到盖亚镇，她就会给战士们空气之水作为回报。
到翁拉克镇，潜水舰前有女子请求光之战士拯救人鱼族，之后消失（下落不明，生死不明，Square一直没有公布她的结局），光之战士乘潜水舰很快到达海底神殿。在神殿最上层有一些人鱼和一些宝箱，在西北角宝箱中找到罗塞塔石（Slab ロゼッタいし），这是干什么的？先放在包内再说吧。和人鱼对话得知北海巨妖克拉肯在海底神殿最下层，鹰形大陆沙漠中有一座蜃气楼塔进不去。于是在神殿最下层找到水之水晶。击败水之卡欧斯——克拉肯（Kraken クラーケン），水之水晶恢复光辉。
来到梅露蒙多镇，找到右上方的学者乌内（Unne ウネ），请他来解读罗塞塔石上的文字。原来这上面刻的是鲁菲茵语……罗塞塔石具有神奇的力量，触摸它，光之战士很快学会鲁菲茵语！
来到鹰形大陆东方的鲁菲茵人镇（Lefeinルフェインじんのまち），学会鲁菲茵语的光之战士，和那里的居民交谈后得到钟琴（Chime チャイム）。据了解，在镇北的蜃气楼塔只有身上带有钟琴才能进入。而那蜃气楼塔是进入浮游城的入口。鲁菲茵人的祖先天空人具有高度文明，浮游城、飞空艇、机器人等先进设施都是他们的成果，可惜风力被风之卡欧斯提亚马特（Tiamat ティアマット）挡住了，失去风力的天空人败北，浮游城也被提亚马特攻占了。所有的希望放在5位天空战士身上，不幸的是，他们也被恶魔打败了，并且施加了魔法，变身蝙蝠，禁止发言。
从蜃气楼塔到浮游城还需要一样东西。在翁拉克镇顺河流穿过一个瀑布，进入瀑布后面的水帘洞中，找到一个机器人，它交给战士们一个空间歪曲方块（Cube ワープキュープ）。这样，光之战士们就可以向浮游城出发了……
四 返回过去
得到钟琴与空间歪曲方块后，进入蜃气楼塔（Mirage tower ミラージュのとう）。楼塔中有许多宝箱，而且放置比较集中。在3楼看到歪域(Warp Zone)，又称瞬移点、传送点，使用身上的空间歪曲方块……
瞬移到浮游城（Floating Castle ふゆうじょう），这是鲁菲茵人的祖先天空人修建的，浮游在高空星海之中。浮游城中没有楼梯，用三角形歪域代替，本质上和楼梯没区别。在浮游城三楼有一个能看到下界的展望窗，从展望窗看到土水火风4股力量像雾一样流入同一场所，这一场所竟然是卡欧斯神殿所在地。
4楼的地形很奇特，环状地形使人迷失方向。要想好怎么走！
浮游城最上层有一条细长的通道，也有人将其称为长桥，通道尽头放着风之水晶……击败风之卡欧斯——提亚马特后，终于恢复了全部四个水晶的光辉。难道这样就结束了吗？
回到新月湖镇，十二位预言家指出，要消灭罪恶的源头必须回到2000年前，恶之元凶如同鸡与卵的关系一样，在2000年时间内反复循环，企图在2000年的时之锁中仙福永享，寿与天齐！必须切断时之锁，将2000年前与现在的世界切断！否则现在的世界无法恢复常态。最终目的地是卡欧斯神殿！
再次来到神殿，神殿中央房间徘徊着5只蝙蝠，实际上是前述5位天空人所变。本来变身蝙蝠后禁止发言，由于光之战士将水晶恢复光辉，在水晶光辉作用下，5只蝙蝠重新获得说话交流能力，依照蝙蝠所说，将4个水晶的光辉一起照射到房间中的黑水晶上，那么4种力量便会聚集在一起，打开时间之门，回到2000年前的卡欧斯神殿……
终于来到了2000年前了，这里危机四伏。在3F中央大房间内有一块充满邪恶之气的石板。这时如果弹奏起序幕中公主赠送的诗琴，就可以破坏邪恶的石板，打开通向最终恶首之路……
最终恶首竟然是阔内利亚骑士噶兰多，他是操纵土水火风4匹卡欧斯的邪恶元凶。当初他在卡欧斯神殿本来已经被光之战士打倒，却利用4匹卡欧斯的力量回到2000年前复活，于是，为了2000年后自己未来的复活着想，他又将4匹卡欧斯送到未来，形成2000年的时之锁，在时之锁中，噶兰多永远不死！果然，如同预言家所说，必须将2000年前与现在的世界切断，也就是说，将现在世界与2000年前的卡欧斯集团余党全部消灭，使其无法利用时之锁复活，坏人不能复活，世界才能恢复常态。
